Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Copz1P61924 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Copz1P61924 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Copz1P61924 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Copz1P61924 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Copz1P61924 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Copz1P61924 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Copz1P61924 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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