Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TspoP50637 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TspoP50637 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TspoP50637 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TspoP50637 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TspoP50637 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TspoP50637 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TspoP50637 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TspoP50637 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TspoP50637 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TspoP50637 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TspoP50637 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TspoP50637 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TspoP50637 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TspoP50637 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TspoP50637 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TspoP50637 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TspoP50637 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TspoP50637 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TspoP50637 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TspoP50637 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TspoP50637 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TspoP50637 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TspoP50637 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms