Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 LINC00571-201ENST00000434565 521 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms