Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms