Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpardP35396 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpardP35396 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpardP35396 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpardP35396 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpardP35396 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpardP35396 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpardP35396 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpardP35396 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpardP35396 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpardP35396 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpardP35396 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpardP35396 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpardP35396 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpardP35396 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpardP35396 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpardP35396 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PpardP35396 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpardP35396 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpardP35396 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpardP35396 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PpardP35396 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpardP35396 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PpardP35396 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpardP35396 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpardP35396 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpardP35396 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpardP35396 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PpardP35396 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpardP35396 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms