Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms