Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtaP09225 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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