Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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PKHD1P08F94 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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