Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna2d1O08532 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna2d1O08532 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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