Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Ddx60E9PZQ1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Ddx60E9PZQ1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Ddx60E9PZQ1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Ddx60E9PZQ1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Ddx60E9PZQ1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Ddx60E9PZQ1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.1 ms