Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cldn9Q9Z0S7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cldn9Q9Z0S7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cldn9Q9Z0S7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cldn9Q9Z0S7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cldn9Q9Z0S7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cldn9Q9Z0S7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cldn9Q9Z0S7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cldn9Q9Z0S7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cldn9Q9Z0S7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cldn9Q9Z0S7 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms