Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB10

Smdt1, Essential MCU regulator, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smdt1Q9DB10 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Smdt1Q9DB10 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Smdt1Q9DB10 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Smdt1Q9DB10 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Smdt1Q9DB10 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
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Smdt1Q9DB10 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smdt1Q9DB10 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smdt1Q9DB10 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smdt1Q9DB10 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smdt1Q9DB10 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smdt1Q9DB10 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smdt1Q9DB10 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smdt1Q9DB10 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smdt1Q9DB10 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smdt1Q9DB10 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smdt1Q9DB10 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smdt1Q9DB10 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smdt1Q9DB10 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smdt1Q9DB10 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smdt1Q9DB10 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smdt1Q9DB10 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smdt1Q9DB10 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smdt1Q9DB10 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smdt1Q9DB10 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smdt1Q9DB10 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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