Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms