Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms