Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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