Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CYI0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CYI0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CYI0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CYI0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CYI0 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CYI0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CYI0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CYI0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CYI0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CYI0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CYI0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CYI0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CYI0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CYI0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CYI0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CYI0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CYI0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CYI0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CYI0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CYI0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CYI0 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CYI0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CYI0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CYI0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CYI0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CYI0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CYI0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CYI0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CYI0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CYI0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CYI0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CYI0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CYI0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CYI0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms