Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms