Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pkn3Q8K045 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms