Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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