Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
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Gm9955Q8CEJ8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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Gm9955Q8CEJ8 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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Gm9955Q8CEJ8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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Gm9955Q8CEJ8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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Gm9955Q8CEJ8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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Gm9955Q8CEJ8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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Gm9955Q8CEJ8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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Gm9955Q8CEJ8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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Gm9955Q8CEJ8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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Gm9955Q8CEJ8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Gm9955Q8CEJ8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Gm9955Q8CEJ8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm9955Q8CEJ8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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