Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntrobQ8CB62 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms