Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cep55Q8BT07 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cep55Q8BT07 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms