Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8BP99 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8BP99 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8BP99 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8BP99 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8BP99 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8BP99 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8BP99 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8BP99 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8BP99 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8BP99 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8BP99 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Q8BP99 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8BP99 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8BP99 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Q8BP99 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8BP99 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Q8BP99 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8BP99 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8BP99 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8BP99 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8BP99 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8BP99 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8BP99 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8BP99 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8BP99 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8BP99 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8BP99 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Q8BP99 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8BP99 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8BP99 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8BP99 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8BP99 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Q8BP99 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8BP99 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Q8BP99 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8BP99 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8BP99 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8BP99 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Q8BP99 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Q8BP99 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Q8BP99 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8BP99 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8BP99 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8BP99 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8BP99 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8BP99 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8BP99 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8BP99 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8BP99 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8BP99 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8BP99 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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