Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ubash3bQ8BGG7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ubash3bQ8BGG7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ubash3bQ8BGG7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ubash3bQ8BGG7 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ubash3bQ8BGG7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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