Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf187Q8BFX1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rnf187Q8BFX1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rnf187Q8BFX1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rnf187Q8BFX1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rnf187Q8BFX1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rnf187Q8BFX1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rnf187Q8BFX1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf187Q8BFX1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Rnf187Q8BFX1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Rnf187Q8BFX1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf187Q8BFX1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rnf187Q8BFX1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf187Q8BFX1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf187Q8BFX1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf187Q8BFX1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf187Q8BFX1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf187Q8BFX1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf187Q8BFX1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf187Q8BFX1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf187Q8BFX1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf187Q8BFX1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf187Q8BFX1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf187Q8BFX1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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