Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms