Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms