Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms