Protein–RNA interactions for Protein: Q61772

Epha7, Ephrin type-A receptor 7, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha7Q61772 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Epha7Q61772 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha7Q61772 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha7Q61772 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Epha7Q61772 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Epha7Q61772 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Epha7Q61772 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Epha7Q61772 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Epha7Q61772 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha7Q61772 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha7Q61772 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha7Q61772 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Epha7Q61772 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Epha7Q61772 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha7Q61772 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha7Q61772 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha7Q61772 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha7Q61772 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha7Q61772 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha7Q61772 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha7Q61772 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha7Q61772 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha7Q61772 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Epha7Q61772 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha7Q61772 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Epha7Q61772 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha7Q61772 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Epha7Q61772 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha7Q61772 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha7Q61772 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha7Q61772 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha7Q61772 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha7Q61772 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha7Q61772 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha7Q61772 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha7Q61772 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha7Q61772 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha7Q61772 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha7Q61772 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Epha7Q61772 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha7Q61772 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Epha7Q61772 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha7Q61772 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha7Q61772 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha7Q61772 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Epha7Q61772 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha7Q61772 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Epha7Q61772 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha7Q61772 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha7Q61772 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha7Q61772 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha7Q61772 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha7Q61772 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha7Q61772 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha7Q61772 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha7Q61772 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha7Q61772 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Epha7Q61772 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Epha7Q61772 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Epha7Q61772 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Epha7Q61772 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha7Q61772 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha7Q61772 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha7Q61772 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Epha7Q61772 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha7Q61772 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha7Q61772 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha7Q61772 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha7Q61772 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha7Q61772 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha7Q61772 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Epha7Q61772 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epha7Q61772 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epha7Q61772 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epha7Q61772 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epha7Q61772 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Epha7Q61772 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epha7Q61772 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epha7Q61772 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Epha7Q61772 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Epha7Q61772 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Epha7Q61772 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Epha7Q61772 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Epha7Q61772 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epha7Q61772 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epha7Q61772 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epha7Q61772 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Epha7Q61772 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Epha7Q61772 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epha7Q61772 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epha7Q61772 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Epha7Q61772 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Epha7Q61772 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Epha7Q61772 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Epha7Q61772 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epha7Q61772 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epha7Q61772 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Epha7Q61772 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epha7Q61772 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epha7Q61772 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms