Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms