Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Ulk3Q3U3Q1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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