Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms