Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms