Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gdf9Q07105 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gdf9Q07105 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf9Q07105 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms