Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms