Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rps11P62281 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps11P62281 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rps11P62281 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rps11P62281 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rps11P62281 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rps11P62281 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rps11P62281 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps11P62281 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps11P62281 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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