Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms