Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nphp4P59240 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms