Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Cldn18P56857 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Cldn18P56857 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Cldn18P56857 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Cldn18P56857 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Cldn18P56857 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn18P56857 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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