Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PctpP53808 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PctpP53808 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PctpP53808 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PctpP53808 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PctpP53808 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PctpP53808 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PctpP53808 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PctpP53808 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PctpP53808 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PctpP53808 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PctpP53808 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PctpP53808 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PctpP53808 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PctpP53808 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PctpP53808 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PctpP53808 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms