Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa6P50704 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms