Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms