Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms