Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms