Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RhoP15409 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhoP15409 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms