Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RaraP11416 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RaraP11416 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RaraP11416 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RaraP11416 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RaraP11416 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RaraP11416 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RaraP11416 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RaraP11416 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RaraP11416 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RaraP11416 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RaraP11416 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RaraP11416 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RaraP11416 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RaraP11416 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RaraP11416 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RaraP11416 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RaraP11416 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RaraP11416 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RaraP11416 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RaraP11416 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RaraP11416 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RaraP11416 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RaraP11416 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RaraP11416 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RaraP11416 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RaraP11416 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms