Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms