Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk2O35491 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk2O35491 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk2O35491 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk2O35491 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Clk2O35491 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Clk2O35491 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Clk2O35491 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Clk2O35491 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Clk2O35491 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Clk2O35491 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Clk2O35491 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Clk2O35491 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Clk2O35491 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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