Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms