Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf4bG5E8Z2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms